ÖZ

Amaç

Marfan sendromu (MFS), genellikle FBN1 genindeki mutasyonlardan kaynaklanan genetik bir bağ dokusu bozukluğudur. Son yıllarda, gen ekspresyonunu post-transkripsiyonel düzeyde düzenleyen mikroRNA’ların (miRNA’lar) bu hastalıktaki rolü ön plana çıkmaktadır. Bu çalışmanın amacı, FBN1 transkriptini hedef alan miRNA’ları sistematik olarak tanımlamak ve potansiyel düzenleyici etkileşimleri ortaya çıkarmaktır.

Yöntemler

İnsan miRNA dizileri miRBase (Sürüm 22.1) veri tabanından alınmış ve FBN1 geninin referans transkripti (RefSeq: NM_000138.5) Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi üzerinden elde edilmiştir. psRNATarget sunucusu kullanılarak FBN1 ile etkileşime giren miRNA’lar tahmin edilmiştir. En güçlü etkileşime sahip aday miRNA’ların ekspresyon düzeyleri ve hastalıklarla ilişkileri veri tabanları ve literatür taramaları ile değerlendirilmiştir.

Bulgular

Toplamda 2656 insan miRNA’sı analiz edilmiş ve bunlardan 251’inin FBN1 transkripti ile potansiyel bağlanma bölgeleri olduğu öngörülmüştür. Özellikle hsa-miR-181 ailesi çok sayıda bağlanma bölgesiyle dikkat çekmiştir. Literatür bulguları, bu miRNA ailesinin MFS hastalarında aşağı düzenlendiğini göstermektedir.

Sonuç

Bu çalışma, hsa-miR-181 ailesinin FBN1 üzerindeki düzenleyici etkisini ortaya koyarak MFS’ndaki potansiyel moleküler mekanizmalara ışık tutmaktadır. Elde edilen bulgular, RNA temelli tedavi yaklaşımları için yeni hedeflerin geliştirilmesinde kullanılabilir.