ÖZET
Sonuç:
KML hastalarındaki BCR-ABL1 transkript düzeyinin ölçümünde, RTdijital PCR yöntemi RT-qPCR yöntemine göre anlamlı düzeyde daha hassas bulunmuştur, fakat bu üstünlük tüm örneklerde RT-dijital PCR lehine değildir. Bu sebeple, RT-dijital PCR yönteminin etkinliğinin daha iyi anlaşılabilmesi için daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır.
Bulgular:
Farklı yöntemlerden elde edilen BCR-ABL1/ABL oranları kıyaslandığında iki yöntem arasında anlamlı düzeyde farklılık tespit edildi (p=0.017) (Tablo 1).
Yöntem:
Toplamda 39 KML hastası çalışmaya alındı. RNA izolasyon kiti (QIAamp RNA Blood Mini Kit) ile total RNA izole edildi.RT-qPCR yöntemi için Qiagene Rotor-Gene-Q sistemi,RT-dijital PCR yöntemi içinQX200™ Droplet Digital™ PCR (ddPCR™) sistemi kullanıldı.
Amaç:
Kronik myeloid lösemi (KML), myeloproliferatifneoplaziler içerisinde sınıflanmış bir hematolojik malignitedir. t(9;22)(q34;q11) translokasyonu ile oluşan Philadelphia kromozomu ile BCR/ABL1 füzyon geni oluşur. Philadelphia kromozomu, neredeyse bütün KML vakalarında tespit edilmektedir. RT-qPCR yöntemi, BCR/ABL1 füzyon geninin kantitatif ölçümünde rutinde en sık kullanılan yöntemdir. RT-dijital PCR yöntemi, alternatif bir yöntem olarak değerlendirilebilir fakat, bu konuda şimdiye kadar literatürde yapılmış yeterli düzeyde çalışma yoktur. Bu çalışmada, RT-qPCR ve RT-dijital PCR yöntemlerinin BCR-ABL1 transkriptlerini tespit etme ve ölçümleme başarılarının kıyaslaması planlandı.
